學習重點 區分等價異構(isosterism)與生物電子等排(bioisosterism):前者著重電子與結構的對應,後者重視基團替換後的生物作用。 掌握等電子體判斷:CH₂N₂ 與 CH₂CO的價電子總數均為 16,且具有相應的骨架排列。 記住Hinsberg 提出環等價(ring equivalents)觀念,代表比較為 benzene、thiophene 與 pyridine。 熟記三組生物電子等排:tetrazole/羧酸、indomethacin/sulindac、estradiol/trans-diethylstilbestrol。 理解先導化合物與核心結構來源:bemesetron 的核心結構源自 cocaine,不能僅由作用受體推測來源。 核心觀念 一、等價異構與生物電子等排 等價異構是以原子、基團或分子的電子配置及結構相似性,解釋其物理化學性質可能相近。此處的「異構」不可直接當成一般有機化學的「同分異構」;互為等價異構物的化合物,不必具有相同分子式。 生物電子等排則把概念應用於藥物設計:以具有適當形狀、大小、電性、酸鹼性或氫鍵能力的原子、基團或骨架,取代原來結構,以維持所需的生物作用,並嘗試改善選擇性、代謝穩定性或其他藥物性質。並非任意兩個作用相似的藥物,都可直接認定為生物電子等排。 學者主要貢獻辨識關鍵 Langmuir提出 isostere 概念,著重電子數及電子排列的相似性等電子、isostere Grimm提出氫化物置換定律,以加氫形成的基團說明等價關係–CH₃、–NH₂、–OH、–F 的對應 Hinsberg提出環等價觀念benzene、thiophene、pyridine Friedman提出 bioisostere 用語,把生物活性納入考量生物電子等排 環等價的重點,是不同環系可以在適當情況下互相替換。例如 benzene 與 pyridine 可比較環上 –CH= 與 –N= 的替換;benzene 與 thiophene 則可比較 –CH=CH– 與 –S– 的對應。環的原子數不必完全相同,替換後的活性仍須實際驗證。 二、等電子體的判斷:CH₂N₂ 與 CH₂CO 先計算價電子總數,再檢查原子數與骨架排列是否相應。常用價電子數為 H=1、C=4、N=5、O=6;不要把價電子數與包含內層電子的總電子數混用。 化合物價電子計算合計 CH₂N₂,重氮甲烷4+2×1+2×516 CH₂CO,烯酮,CH₂=C=O2×4+2×1+616 CH₃OH,甲醇4+4×1+614 CH₂=CH₂,乙烯2×4+4×112 CH₂=NOH,甲醛肟4+3×1+5+618 重氮甲烷可用 CH₂=N⁺=N⁻ 等共振式描述,與烯酮 CH₂=C=O 有相應的骨架關係。兩者皆有五個原子、16 個價電子,可視為CH₂N₂/CH₂CO 的等價異構配對。電子數相同是重要線索,但不能把「任何價電子總數相同的分子」一律視為等價異構物。 三、Tetrazole 與羧酸的生物電子等排 本單元所指的 R-tetrazole,是保有可解離 N–H 的碳取代 tetrazole,可作為 R-COOH 的生物電子等排體。其酸性及解離後的負電荷分布,能在適當結構中模擬羧酸基與標的之間的作用。 判斷核心是酸性基團及其陰離子形式的對應,而非單看是否含氮。R-NH₂、R-SH、R-CHO 均不是此處的標準配對。部分 sartan 類藥物可見 tetrazole,但並非所有 sartan 都具有 tetrazole,也不是所有 tetrazole 衍生物都保有相同酸性。 四、Indomethacin 與 sulindac Sulindac 是由 indomethacin 的生物電子等排設計發展而來的代表藥物。結構辨識重點為 indomethacin 的 indole(吲哚)骨架,對應到 sulindac 的 indene(茚)骨架。 可用「含氮五員環改為碳環」掌握主要差異,但完整藥物還涉及取代基等多處調整,不能理解成只換一個原子就得到 sulindac。Etodolac、diclofenac、zomepirac 雖同屬非類固醇抗發炎藥,不能僅因用途相近就認定為這組等排設計的產物。 五、Estradiol 與 trans-diethylstilbestrol Estradiol 是類固醇雌激素;trans-diethylstilbestrol(trans-DES,反式己烯雌酚)是非類固醇雌激素。兩者骨架不同,但關鍵羥基及疏水結構的空間配置可形成相近的受體辨識特徵,因此屬於生物電子等排體。 此例說明:保留重要的立體配置與作用特徵,不一定要保留完整類固醇骨架。Estradiol 與 DES 的分子式不同,因此不是鏡像異構物、非鏡像立體異構物,也不是因單鍵旋轉而互換的構形異構物。此組配對應記住 trans 構型。 六、先導化合物、核心骨架與藥效團 先導化合物是具有可利用生物活性、可供後續修飾的起點,來源包括天然物、內生性配體與既有藥物。研究者可調整取代基、替換環系或運用生物電子等排,發展所需性質更合適的化合物。 核心骨架指主要結構框架;藥效團則是與標的作用所需的關鍵立體及電子特徵,兩者並非完全同義。不同骨架可以呈現相似藥效團,同一骨架的衍生物也可能具有不同作用。 Bemesetron 是選擇性 5-HT3 拮抗劑,其 tropane 相關核心結構源自 cocaine。Serotonin 雖是 5-HT3 受體的內生性配體,卻不是本例的核心結構來源;aspirin 與 quinine 也不是此配對。必須分清楚「作用於哪個受體」與「結構由何者衍生」。 常考陷阱 把 tetrazole 配成胺基:含氮不等於胺類;本例應從酸性與解離形式辨認其對應羧酸。 只看分子式外觀:CH₂N₂ 的配對是 CH₂CO;先算出兩者均為 16 個價電子,再比較骨架。 把學者貢獻互換:看到 benzene、thiophene、pyridine 與 ring equivalents,應連結 Hinsberg。 把同類藥物當成等排配對:indomethacin 對應 sulindac,辨識線索為 indole/indene。 把 bioisosteres 當成立體異構物:estradiol 與 trans-DES 骨架及分子式不同,關係是生物電子等排。 由受體名稱猜結構來源:bemesetron 拮抗 5-HT3,但核心來源應記 cocaine,不能直接選 serotonin。 記憶口訣 「四唑對羧酸,環等價找 Hinsberg。」 「重氮配烯酮,價電子十六同。」 「吲哚對茚環,Indo 配 Suli。」 「反式 DES 仿雌二醇;Bemesetron 記古柯鹼。」